Центр был создан 2017 году, Фонд Национального центра сформировался через приобретение книг и рукописей у населения. Пополнение собрания происходило и происходит за счет приобретения целых коллекций и отдельных рукописей за счет передачи собранию рукописей, находившихся в других учреждениях и за счет частных пожертвований отдельных лиц. На сегодняшний день фонд составляет более 6 тысяч книг и рукописей.

Национальный центр рукописей и редких книг налаживает сотрудничество с зарубежными и государственными организациями. Уже такие связи налажены с более 30-тиотечественными и 10-ти зарубежными учреждениями. С целью повышения квалификации реставраторов и перенятия успешного опыта коллег были осуществлены служебные командировки в Турецкую Республику, Российскую Федерацию, Республику Узбекистан, Исламскую Республику Иран, Армению, Японию и Корею.

В Национальном центре есть специальное хранение рукописей и редких книг. Поступившие в фонд старые книги сначала дезинфицируются, затем, при необходимости, проводятся реставрационные работы, а затем книга отправляется в фонд на хранение.

В настоящее время сотрудники Национального центра выявляют  ценных трудов по истории средневекового казахского государства, хранящиеся в зарубежных библиотеках, переводят их и вводят в научный оборот, а также пропаганда письменных источников и центра в средствах массовой информации, среди молодежи.

15 ноября 2018 г. в рамках программы «Рухани жаңғыру» состоялась церемония открытия лаборатории «Реставрация и консервация». Зал оснащен оборудованием, которое в состоянии выполнять полный спектр реставрационно-консервационных работ с документами на бумажных носителях. Благодаря функционированию Зала реставрации и консервации у Национального центра появилась возможность дезинфицировать, дезинсецировать, отреставрировать, переплетать и оцифровывать любой бумажный документ в комплексной форме.

Собранные в рукописном фонде произведения написаны на арабском, персидском, таджикском, турецком, татарском, чагатайском, тюркском языках и относятся к XIX-XX векам. Эти произведения посвящены разным вопросам истории, истории литературы, философии, праву, астрономии, физике, химии, медицине, языку, фармакологии, географии, музыке, математике, минералогии, изобразительному искусству и др.